Бонанно на заре своей карьеры сыграл немаловажную роль в формировании Комиссии, которая первоначально включала в свой состав семь боссов. Задачей этого органа было мирное разрешение возникающих между семьями споров, принятие компромиссных решений, исключающих возможное в таких случаях кровопролитие. До создания такой Комиссии подобные проблемы решались на уровне самого мощного лидера, который принимал по возникшей проблеме единоличное волевое решение. Такая альтернатива была более опасна, поскольку не все были согласны подчиниться мнению лидера.

Практика показала, что первоначальный метод решения конфликтов породил таких мафиозных деспотов, какими были Маранзано или Массерия. Такого повторения не желал никто.

Семейство Бонанно во главе с ним самим процветало более трех десятков лет. Его власть не подвергалась угрозам, возможно, из-за наличия могущественных союзников, которые доминировали над Комиссией. Семья Бонанно за эти годы сколотила огромное состояние, наживаясь на торговле наркотиками, рэкете и, конечно же, азартных играх. Наркотический бизнес Бонанно расширил до канадского Монреаля. Именно здесь и находился впоследствии главный перевалочный пункт героина, поставляемого между США и Европой.